动力学[7] | Criticality, 生物系统处于临界状态吗 阿掖山:一个博客 2026年3月2日 08:00 Are biological systems poised at criticality? 论文笔记的第三部分;动力学笔记的第七部分
.tex | 生物系统处于临界状态吗:最大熵原则 阿掖山:一个博客 2026年2月8日 08:00 Mora, T., & Bialek, W. (2011). **Are biological systems poised at criticality?** Journal of Statistical Physics, 144(2), 268-302. 论文笔记的第二部分
.tex | 生物系统处于临界状态吗:Zipf 定律 阿掖山:一个博客 2026年1月25日 08:00 论文笔记 Mora, T., & Bialek, W. (2011). Are biological systems poised at criticality? Journal of Statistical Physics, 144(2), 268-302. 第 1 部分
.tex | 一份概率论临时抱佛脚的笔记 阿掖山:一个博客 2025年11月4日 08:00 博二的时候在医学院上过一门工程学院计算机系开设的《计算生物学算法》的课,里面小半个学期在用 Mathematica 以一袋骰子为例,算后验期望最大化,需要概率论作为预备知识。
.tex | 一份概率论临时抱佛脚的笔记 阿掖山:一个博客 2025年11月4日 08:00 博二的时候在医学院上过一门工程学院计算机系开设的《计算生物学算法》的课,里面小半个学期在用 Mathematica 以一袋骰子为例,算后验期望最大化,需要概率论作为预备知识。
.tex | 一份微积分的自学指南 阿掖山:一个博客 2025年10月24日 08:00 4 个星期速通微积分。总的学习内容被分成了 20 个模块,通过跳过部分内容,可以按照两种难度(入门/进阶),三种强度(每周 5 小时/ 10 小时/ 15 小时)定出 6 种学习方案。
.tex | 一份线性代数的自学指南 阿掖山:一个博客 2025年10月23日 08:00 学习方案是最有价值的。很多“民间科学家”或是思而不学则殆,或是追捧一些不学就会的天才传说,并不一定是好逸恶劳,可能只是不得其法。
.pdf | 马克思-列宁主义及其知名批判著作导读 | 编程随想 阿掖山:一个博客 2025年10月18日 08:00 https://program-think.blogspot.com/2018/09/Book-Review-The-Errors-of-Marxism-Leninism.html
学术交锋 | Nick Lane et al. vs. Michael Lynch et al. 论复杂生命的基因组 阿掖山:一个博客 2025年10月17日 08:00 之前写过 Nike Lane 的《The Vital Question》这本书的读书笔记,里面提到这本书的部分观点并非学界共识,而有激烈争论。当时没说得太细,这次补充一下。也可作为英语阅读和逻辑思维的学习素材。
谁是 505b 和 c0e6 | 做实验还是搞理论 阿掖山:一个博客 2025年9月30日 08:00 搞理论还是做实验?对于物理专业来说,这个问题需要在本科中后期作出回答,最迟到博士资格考试 (qualifier) 定论。
动力学[6] | 通过相图 Phase Diagram 辨析变量、参数、超参数概念 阿掖山:一个博客 2025年9月23日 08:00 本来应该接着讲离散系统的混沌现象,但在这之前势必要讲动力学系统的临界现象和分岔,而分岔指的就是动力学系统相图的分岔
谁是 d7e7 | 生物系统作为计算通路 阿掖山:一个博客 2025年9月10日 08:00 “合成生物学/系统生物学”,斜杠不表示二选一,而是说这个方向在技术研究(把知识转换成钱)的时候自称合成生物学,在科学研究(把钱转换成知识)的时候自称系统生物学——两者互为表里。